PD Dr. Katharina Hoff ist Expertin für die Entwicklung von Software zur Analyse eukaryotischer Genomsequenzen. Ein zentraler Schwerpunkt ihrer Forschung liegt in der Annotation proteinkodierender Gene unter Einsatz von Deep Learning und externer Evidenz, wie beispielsweise transkriptomischen oder proteomischen Daten.
Zu den Softwareprojekten, an deren Entwicklung PD Dr. Katharina Hoff maßgeblich beteiligt war, gehören unter anderem:
PD Dr. Katharina Hoff unterstützt Alg4Nut (Arbeitspaket 4) mit ihrer Expertise in der Assemblierung und Annotation von Long-Read-Metagenomsequenzen. Ihr besonderer Fokus liegt auf der Analyse des eukaryotischen Anteils des Pansenmikrobioms. In diesem Zusammenhang betreut sie das Training eines kladenübergreifenden Deep-Learning-basierten Genfinders.